深圳基因测序贡献超全球五成
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截至今年12月初,华大基因已经在《自然》、《科学》等顶级学术杂志上发表了160多篇高水平论文。
仅仅用了15年的时间,深圳企业华大基因就从支持1%人类基因组计划到成长为为世界基因测序贡献超过50%的企业。
2009年以来,深圳陆续将生物产业、生命健康产业分别作为战略性新兴产业和未来产业重点培育和支持,而到2013年深圳的生物产业规模就突破了1000亿元,其基因测序的产出能力占了全球50%以上,并拥有全国唯一的国家基因库,集聚了华大基因、袁隆平院士团队、迈瑞、海普瑞等一批高层次的团队和知名企业。
华大基因研究院院长兼CEO王俊日前接受南方日报采访时称,作为全球规模最大、技术领先的基因组学研究机构,华大基因的研究和临床应用将使得普通人也能负担起基因检测的费用,未来有望借助这个方法增进健康、延长寿命。据其介绍,目前个人全基因组测序价格接近上万元,而明年将降低至几千元,华大基因正在计划推出相关新产品。
构建“数据王国”,打造“生物版谷歌”
1999年,华大基因支持了人类基因组计划的1%,而近年来,华大基因的基因测序能力则让其在世界基因测序上的贡献超出了50%。当1999年成立的华大基因2007年迁至深圳时,它被形容为“裸奔”而来。如今,华大基因5000余名员工分布在世界各地,平均年龄仅27岁。位于深圳盐田区北山工业区的华大基因总部,前身是一个旧鞋厂,而2017年将启用的、位于深圳大梅沙的华大基因中心,将更能体现其在国际生物领域的领先地位。
2010年,华大基因购入了128台世界上最先进的DNA测序仪器,当时每台市场报价约70万美元。2013年底,华大坐拥178台不同品牌的测序仪,每年可实现5万人的基因组测序,数据生产规模达到近5PB,输出的数据量约占全球基因组数据总量的50%。
在外界看来,早期的华大基因似乎像是一个巨型数据生产机,甚至被不少人误认为是“生物领域的富士康”,但华大基因对海量生物信息数据的处理、分析和解读能力,是其跻身国际基因组领域一流研究机构的关键要素,这种优势使其越来越难以复制和替代。自1999年成立以来就一直很重视大数据的华大基因,正在构建一个“数据王国”,提出打造“生物版谷歌”的未来畅想,对于生物技术与大数据碰撞的前景表示乐观。
生物技术是全球继信息技术之后发展速度最快、发展潜力和空间最大的产业,也是将会在未来几十年对全球经济影响最深刻的产业,以基因组学为代表的前沿的生物技术推动着人类对生命世界的认识水平发生质的飞跃。全球顶尖科研机构和企业都通过与华大基因的合作来强化自身在组学领域的能力,加速自身的研发进度,以便将相关科学发现、新技术更快地推向产业化。
2014年12月12日,华大基因、深圳国家基因库、《科学》杂志等联合发布了中外200余位科学家共同完成的鸟类基因组系统演化史项目重大成果,当天,在《科学》和其他杂志上以专刊形式集中公布了28篇首期研究成果,这些成果中有8篇刊登在《科学》鸟类专刊上,其余20篇将陆续刊登在GenomeBiology等杂志上。这也是国内机构首次以专刊的形式在《科学》杂志上发表如此多的研究成果。
深圳市市长许勤在12日的发布会上评价,华大基因的成就影响着全球的生物技术和生物产业的发展。他表示:“以基因组学为代表的前沿的生物技术推动着人类对生命世界的认识水平发生质的飞跃,我们认识客观世界最后来认识自身,是一个国家和地区生物技术发展水平的集中体现”。
华大基因创始人之一、董事长汪建称,科学界特别是民间科学界、民营的科学家也能在深圳创造出影响世界发展的奇迹,做出引领型的创新,相信我国未来的创新也能够从“追赶型”更多地向“引领型”转变。
华大基因的重点研究方向包括人类健康、动植物基因组、微生物基因组等。从创立初期的人类基因组测序计划,到2003年破译SARS病毒基因组序列,到研制出埃博拉病毒核酸检测试剂,华大基因颠覆了主流科研单位的实验室模式,用工业化的组织方法来实现大数据采集,将BT与IT高度结合。截至今年12月初,华大基因已经在《自然》、《科学》等顶级学术杂志上发表了160多篇高水平论文。
明年华大测序成本将大幅降低
在研究成果层出不穷的同时,华大基因在产业化方面也取得了很多进展,旗下的华大科技、华大医学、华大农业、华大制造等机构在各个领域不断开拓。
2013年3月,华大基因通过旗下子公司并购了美国纳斯达克上市公司CompleteGenomics(简称“CG”),CG让华大基因有了自己的“军工厂”,不再依赖进口测序仪器。面对即将“爆发”的基因测序市场,华大基因可以大规模生产各种测序仪器。
王俊近日告诉记者,华大基因收购CG后,已经完全把测序的平台自主化、国产化,在此基础之上使得测序成本超摩尔定律的发展应用在基因组学领域,15年前做一个人类基因组需要花费30亿美金,现在已经接近上万,明年又可以再降低,几千元就可以做一个人的全部基因组。
“我们不是以盈利为目的的机构,也不是以发表文章为目的的机构,我们就是想用基因组的平台和技术,最终做点老百姓能受用的事。”王俊曾告诉记者,华大所有的研究都是从民生应用开始思考,研究沿着产业链逆流而上,每一项研究领域如农业、生育健康、肿瘤、慢性病等都有从科研到产业化的完整链条。
在医学方面,以基因测序领域最广为人知的、针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测为例,截至12月初,华大基因已在全球范围内做了40万例无创产前基因检测。随着多种基因检测项目的增加,华大医学的业务预计会有很大的发展空间和上升潜力。
在农业育种方面,华大基因计划建立世界领先的基因分型平台、基因挖掘平台和全基因组分子育种技术平台,其中开放的育种平台将向大中小企业开放,基于该平台,中小型公司投入一两百万元甚至几十万元,就可以在两三年内确保实现一个动物或植物品种的改良,有利于保障农业生态的安全。
作为华大基因旗下最年轻的机构,华大制造过去近一年时间里建立了深圳、武汉两地的仪器和试剂生产车间、质量管理体系。2014年7月,华大制造的第一个系列产品——两款测序仪及配套的胎儿染色体非整倍体检测试剂盒,获得了CFDA医疗器械注册证,这是全球首个获批的真正意义上的高通量测序临床应用产品。
■数字
96个疾病位点
华大基因旗下的华大科技今年11月起启动了宠物基因检测项目,主要针对宠物狗单基因遗传病进行检测,范围涉及到视力、肾脏、骨骼、神经、皮肤等方面的。随着技术的成熟,华大科技后续将推出宠物狗品种鉴定、育种指导等服务,同时也会开发其他宠物(猫,鸟)的基因检测项目。
100万英镑
华大基因今年7月与英国爱丁堡大学签署合作协议,双方将携手推动人工合成酵母基因组研究的突破,开展高达100万英镑的人工合成生物学项目,在EdinburghGenomeFoundry进行酵母七号染色体合成。酵母七号染色体基因组合成的成果将广泛应用于化工生产、能源和粮食领域,以维持和改善人类健康和环境。
1267个人体
肠道微生物样本
华大基因研究院等多家单位的科研人员今年7月联合发表了迄今为止最具代表性、最高质量、近乎完整的人类肠道微生物参考基因集数据库,研究成果在国际期刊《自然生物技术》在线发表。
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